2x01: El embotellamiento
Después de salir del parque acuático, la familia se queda atascada en un embotellamiento. Francis apuesta a sus compañeros en la escuela que se puede comer 100 píos. Dewey busca el camino a casa.
2x02: Un día de brujas retrasado
Francis va a visitar la casa para poder tener con los muchachos un día de brujas posterior al día festivo, para eso construirán una catapulta. Mientras que Hal está muy incomodo por un conductor imprudente, donde construye un tope. Sin embargo, lo destruye. Hal le enseña una lección, robando y mandando al fondo de un lago el automóvil.
Lois les da dinero a los muchachos para que le compren un regalo de cumpleaños. Sin embargo, ellos se lo gastan comprándose golosinas y a Lois solo le compran una revista de bicicletas, esto hace que se decepcione y se vaya de la casa.
La familia sale a cenar con los Kenarbans como presentación. Stevie se venga del maltrato de Reese, y Katie saca su furia reprimida.
La familia pasa unas vacaciones en un casino, y Hal, Malcolm y Reese van vagando en un rango de artillería del ejército después de haber sido expulsados del cómputo de las tarjetas en un juego de casino.
Mientas Hal y Lois van a una convención, una niñera sexy va a cuidar a los muchachos.
Hal encuentra un ropero tirado y piensa que es el regalo perfecto para Lois pero cuando lo abre salen cientos de murciélagos, mientras, Lois y Craig son atentados de un robo en Lucky Aide, donde Craig confiesa su amor por Lois.
Para perderse el baile, Malcolm hace que le den terapia. Lois y Hal descubren
2x09: La obra de teatro Después de salir del parque acuático, la familia se queda atascada en un embotellamiento. Francis apuesta a sus compañeros en la escuela que se puede comer 100 píos. Dewey busca el camino a casa. Francis va a visitar la casa para poder tener con los muchachos un día de brujas posterior al día festivo, para eso construirán una catapulta. Mientras que Hal está muy incomodo por un conductor imprudente, donde construye un tope. Sin embargo, lo destruye. Hal le enseña una lección, robando y mandando al fondo de un lago el automóvil. Lois les da dinero a los muchachos para que le compren un regalo de cumpleaños. Sin embargo, ellos se lo gastan comprándose golosinas y a Lois solo le compran una revista de bicicletas, esto hace que se decepcione y se vaya de la casa. La familia sale a cenar con los Kenarbans como presentación. Stevie se venga del maltrato de Reese, y Katie saca su furia reprimida. La familia pasa unas vacaciones en un casino, y Hal, Malcolm y Reese van vagando en un rango de artillería del ejército después de haber sido expulsados del cómputo de las tarjetas en un juego de casino. Mientas Hal y Lois van a una convención, una niñera sexy va a cuidar a los muchachos. Hal encuentra un ropero tirado y piensa que es el regalo perfecto para Lois pero cuando lo abre salen cientos de murciélagos, mientras, Lois y Craig son atentados de un robo en Lucky Aide, donde Craig confiesa su amor por Lois. Para perderse el baile, Malcolm hace que le den terapia. Lois y Hal descubren que tienen segundo baño, sin embargo, lo esconden. Francis se encarga de lavar ropa en la militarizada.
Hal y Dewey construir una utopía privada de los bloques de plástico. Mientras que Malcolm le toca el papel principal en la obra de la preparatoria, pero deja alado todo, por los chismes que lo rodean.. 
Después de haber sido golpeado por una niña en una pelea de lucha grecoromana, Reese abandona su imagen de la intimidación, provocando que los niños que le tenían mucho temor empiezen aprovecharse de la situación para poder vengarse de Malcolm por hacer comentarios burlones hacia ellos. Mientras tanto.2x11: La Vieja Señora Vieja
Después de romperle por accidente el brazo a una anciana, Malcolm debe ayudarla en sus labores cotidianas. Richie, el amigo de Francis, es enviado a la militarizada, donde se gana la amistad del comandante. 
Malcolm conoce a la nueva niña Cynthia, que comienza a tener un flechazo con él. 
Hal termina en crisis por mención de un niño de la clase de Dewey, así que deja el trabajo y se pone a pintar. Francis se ve obligado a trabajar en Lucky Aide. 
Los padres de Lois visitan la casa. Víctor habla con Reese, en tanto que Ida molesta a Malcolm. Hal compra un refrigerador nuevo, que es destruido en un incidente con una granada de mano. Hal amenaza a los padres de Lois, pidiéndoles dinero.
Lois es infraccionada por interrumpir el paso a un vehículo por un policía corrupto, Craig le muestra un video a Malcolm y resultaba que Lois se había equivocado, luego este muestra el video a Hal y después se lo enseñan a Lois, después admite de que se había equivocado al final que no era verdad ya que desde otra toma se ve que Lois tenia razón. Después, Hal destruye la evidencia y Lois no se entera. 
Lois obliga a Malcolm a que le dé clases a Reese para que suba sus calificaciones. Los esfuerzos llegan ser positivos, sin embargo, el maestro de Reese quien está en contra de él trata de sabotear sus esfuerzos para poder enviarlo a una clase lento aprendizaje y Malcolm quien ya sabe las intenciones del maestro,tratará de resolver un examen en lugar de Reese para que él pase con una buena calificación. 
El episodio se divide en 2 partes. En éstas, se ven las perspectivas de los personajes, si uno de ellos se los hubiera llevado al boliche. Las dos partes terminan con finales parecidos. 
Malcolm y Reese pelean para ver quién irá con Francis a ver la lucha libre, sin embargo, Francis no se lleva a nadie. Dewey está a cargo del gato de Craig, pero se le escapa. Hal lo atrae con comida, pero termina atrayendo a otros gatos. Por deshacerse de todos, accidentalmente Lois quema el apartamento de Craig intentando que el gato vuelva, por lo cual se ven obligados a que Craig y su gato vivan con ellos. 
Craig vive en casa de la familia, donde descubren el modo de vida de Craig. Mientras, los chicos encuentran y reparan una minimoto, en la que Reese se lesiona. 
Hal y Dewey dejan un sofá en las vías férreas, y la ciudad termina siendo evacuada después de que un tren que contenía desechos tóxicos chocara contra el sofá. Reese intenta hacer mercado negro con los demás. Dewey finge perder a sus padres, para ganar dinero. Tras algunas peleas con su madre (incluyendo el peor bochorno vergonzoso público con un niño), Malcolm logra dormir en un catre. 
Lois y Hal están discutiendo porque creen que Lois esta embarazada, mientras se muestran los nacimientos de los niños. 